ÚTEF - Ústav technické a experimentální fyziky ČVUT - České vysoké učení technické v Praze
Česky English
ÚTEF - Ústav technické a experimentální fyziky ČVUT - České vysoké učení technické v Praze
ČVUT - České vysoké učení technické v Praze
Dílčí úkoly  > Zobrazování biologických vzorků pomocí rentgenového záření
Zobrazování biologických vzorků pomocí rentgenového záření

Základem tohoto zobrazování je využití rentgenového záření a detektorů Medipix2 ke zobrazování vnitřních struktur vzorku/tkáně. Pomocí této metody je možno získat radiografické snímky a po zpracování těchto snímků provádět 3D rekonstrukce objektů tzv. výpočetní tomografii. Mezi naše zobrazované objekty patři např. kosti, myši, termiti, brouci, dřevo apod.
Na obrázku je zobrazen živý bílý červ.



Řešitel

Spolupracovníci

Granty:
Číslo Název Agentura
LC06041 Centrum základního výzkumu "Příprava, modifikace a charakterizace materiálů energetickým zářením" MŠMT
MSM 6840770040 Výzkumný záměr 40: Využití radionuklidů a ionizujícího záření. MŠMT


Vše
(34)
Textový výpis
Rok

Ocenění Název Autor Časopis OceněníRok
Evaluation of sample holders designed for long-lasting X-ray micro-tomographic scans of ex-vivo soft tissue samples Dudák J.; Žemlička J.; Krejčí F.; Karch J.; Patzelt M.; Zach P.; Sykora V.; Journal of Instrumentation 2016
Displacement tracking in single human trabecula with metal-plated micro-spheres using X-ray radiography imaging Jiroušek O.; Kytýř D.; Doktor T.; Krejčí F. Journal of Instrumentation 8 C02041 2013
2012 International Science & Engineering Visualization Challenge - Honorable Mention X-ray micro-radiography and microscopy of seeds Sýkora V.; Žemlička J.; Krejčí F.; Jakůbek J. Science 339 (6119), 511 2013
Detection of Soft X-rays with the Pixel Detector Timepix operated as a highly sensitive Dark-Current free CCD-like Camera Krejčí F.; Kroupa M.; Jakůbek J.; Brůža P.; Pánek D. 2011 IEEE Nuclear Science Symposium Conference Record, NP5.S-166, 1708 - 1712 2012
Award for the first best poster Microradiography of biological samples with Timepix Dammer J.; Weyda F.; Benes J.; Sopko V.; Jakůbek J.; Vondracek V. JINST 6 C11005 doi:10.1088/1748-0221/6/11/C11005 2011
Single grating method for low dose 1-D and 2-D phase contrast X-ray imaging Krejčí F.; Jakůbek J.; Kroupa M. Journal of Instrumentation 6 C01073 2011
X-ray color imaging with 3D sensitive voxel detector Soukup P.; Jakůbek J.; Jandejsek I.; Žemlička J. JINST 6 C12014 doi:10.1088/1748-0221/6/12/C12014 2011
XUV radiation from gaseous nitrogen and argon target laser plasmas Vrba P.; Vrbová M.; Brůža P.; Pánek D.; Krejčí F.; Kroupa M.; Jakůbek J. Journal of Physics: Conference Series 2011
Hard x-ray phase contrast imaging using single absorption grating and hybrid semiconductor pixel detector Krejčí F.; Jakůbek J.; Kroupa M. Rev. Sci. Instrum. 81, 113702 2010
Low dose X-ray phase contrast imaging sensitive to phase effects in 2-D Krejčí F.; Jakůbek J.; Kroupa M. IEEE NSS/MIC/RTSD Knoxville Conf. Record M09-166, doi: 10.1109/NSSMIC.2010.5874172 2010
New approach in phase contrast X-ray imaging using coded aperture Krejčí F.; Jakůbek J.; Kroupa M. 11th ICATPP Conference, Villa Olmo - Como (Italy), 5-9 October 2009, ISBN 10 981-4307-51-2, pp. 59 – 63 2010
Real-time in-vivo µ-imaging with Medipix2 Dammer J.; Frallicciardi P.; Jakůbek J.; Jakůbek M.; Pospíšil S.; Prenerová E.; Vavřík D.; Volter L.; Weyda F.; Zemek R. NIM A, Vol. 607, Issue 1, p. 205-207 2009
Digitální transmisní radiografie s pixelovými detektory Medipix Jakůbek J.; Dammer J.; Holý T.; Platkevič M.; Uher J.; Vykydal Z. Československý Časopis pro Fyziku, 1/2008, 25-36 2008
Invited contribution. Energy sensitive micro-radiography and micro-tomography of biological samples allowing tissue type recognition with semiconductor pixel detectors of Medipix family Jakůbek J. EPSM ABEC 2008, Conference handbook, ISBN 0 8582 5872 2, (p. 265) 2008
Mikroradiografie biologických objektu pixelovými detektory Dammer J.; Weyda F. Živa 6/2008, p 286-288 2008
Mikroradiografie biologických vzorků Dammer J.; Jakůbek J.; Vavřík D. Československý Časopis pro Fyziku, 1/2008, 50-52 2008
Pixel Detectors for Imaging with Heavy Charged Particles Jakůbek J.; Cejnarová A.; Holý T.; Pospíšil S.; Uher J.; Vykydal Z. Nucl. Instr. and Meth. A, Volume: 591, Issue:1, Pages: 155-158, doi: 10.1016/j.nima.2008.03.091 2008
Processes in biological microimaging (Supervisor: J. Jakubek) in progress Skrabal P. Master Thesis, Charles U. Prague 2008
Real-Time X-Ray 2-D and 3-D Micro-Imaging of Living Animals with Medipix2 Single Photon Counting Detector Frallicciardi P.; Dammer J.; Weyda F.; Jakůbek J.; Vavřík D.; Pospíšil S. Conf. Proc. IEEE NSS/MIC 2008, M10-112 2008
Real-time in-vivo imaging of small organisms Dammer J.; Jakůbek J.; Hanus R.; Weyda F.; Vavřík D. ICATPP congf. proceedings, p. 640-644 2008
Compact system for high resolution X-ray transmission radiography, in-line phase enhanced imaging and micro CT of biological samples Jakůbek J.; Dammer J.; Granja C.; Holý T.; Pospíšil S.; Uher J. IEEE NSS IEEE NSS Conf. Proc. 4179187 (2007) 1077-1080 2007
Invited contribution.
Awarded by rector of CTU in Prague (2008). Data processing and image reconstruction methods for pixel detectors Jakůbek J. NIM A 576 (2007) 223-234, doi:10.1016/j.nima.2007.01.157 2007
In-vivo real-time X-ray µ-imaging Dammer J.; Holý T.; Jakůbek J.; Jakůbek M.; Pospíšil S.; Vavřík D. AIP Vol. 958 (2007), pp 139 2007
Invited lecture Microadiographic Measurement of Moving Material Structures Vavřík D.; Holý T.; Jakůbek J.; Jakůbek M. Proceedings of International Symposium on Technology for Next Generation Vehicle & Machine (2007) 2007
Microradiography with Semiconductor Pixel Detectors Jakůbek J.; Cejnarová A.; Dammer J.; Holý T.; Platkevič M.; Pospíšil S.; Vavřík D.; Vykydal Z. Amer. Inst. of Physics (AIP) Conf. Proc., Volume: 958, Pages: 131-135, doi: 10.1063/1.2825764 2007
Phase contrast enhanced high resolution X-ray imaging and tomography of soft tissue Jakůbek J.; Granja C.; Dammer J.; Tykva R.; Hanus R.; Uher J.; Vykydal Z. Nucl. Instr. and Meth. A, Volume: 571, Issue: 1-2, Pages: 69-72, doi: 10.1016/j.nima.2006.10.031 2007
Radiography of Chaotically Moving Objects Vavřík D.; Dammer J.; Holý T.; Jakůbek J.; Jakůbek M.; Jandejsek I. AIP Vol. 958 (2007) 139-142 2007
Small-scale in vivo imaging of soft tissues by radioscopy using single X-ray photon counting Hanus R.; Dammer J.; Holý T.; Jakůbek J.; Pospíšil S.; Tykva R. Journal of Microscopy 226 (2007) 191–194 2007
Direct thickness calibration: way to radiographic study of soft tissues Vavřík D.; Holý T.; Jakůbek J.; Pospíšil S.; Vykydal Z.; Dammer J. 9th ICATPP 2005 Conf. Proc., Pages: 773-778, doi: 10.1142/9789812773678_0122 2006
Invited contribution High Resolution Soft Tissue Tomographic Imaging using Single X-ray Photon Counting Pixel Device Medipix2 Jakůbek J.; Dammer J.; Holý T.; Pospíšil S.; Uher J. Conf.: New Technics in Lab Animal Science 2006
Normalized model system for the study of termite management Tykva R.; Hanus R.; Jakůbek J.; Wimmer Z.; Vlasáková V. XVIII World Congress IMEKO 2006
Dental Implant Imaging with Pixel Detectors Granja C.; Jakůbek J.; Linhart V.; Cevallos M.; Krug J. IEEE NSS Conference Record (2004) 3872-3876 2004
Non-destructive observation of damage processes by X-ray dynamic defectoscopy Vavřík D.; Jakůbek J.; Pospíšil S.; Visschers J. International Conference on the Mechanical Behaviour of Materials, Conf. Proc. 2003
Hledat
10th Anniversary of IEAP